El presente trabajo, tiene como objetivo mejorar la seguridad y la gestión de la información de la Aplicación Web “Sistema Automatizado para la Gestión de la Información en Rehabilitación”. Para dar solución a este objetivo, se decide continuar programando con diferentes herramientas de software libre como: la tecnología PHP5 utilizando el Zend Studio, como Framework CodeIgniter unido a un Modelo-Vista-Controlador (MVC) y el Sistema Gestor de Base de Datos utilizado fue el MySQL 5.0. El desarrollo del software se definió utilizando la metodología RUP (Proceso Unificado de Desarrollo), se utilizó como apoyo herramientas como el Visual Paradigm para UML 6.0 y para la planificación de las tareas a desarrollar en el trabajo se utilizó el Microsoft Project. La aplicación obtenida facilita la entrada y salida de forma más eficiente de la información en las Clínicas de Rehabilitación. La información está más segura ante cualquier situación externa a la gestión de la información. Facilitar el trabajo del personal de esta área, haciéndolo más cómodo y confortable, evitando el papeleo, la pérdida de la información. El sistema propuesto mejora el acceso a la información y reduce el tiempo de búsqueda de diferentes registros.